Can agents reliably design therapeutic antibodies?
arxiv.org/abs/2611.00558…
LLMエージェントに抗体の親和性改善をやらせたとき、指示にちゃんと従えるのか、何が効くのかを調べた論文。ツールを使わせると指示追従や探索は良くなる一方で最適化性能は下がり、設計履歴を渡すと逆の傾向になる、という面白いトレードオフが出ているようす。最終的にはベイズ最適化と同程度の性能とのこと。
arxiv.org/abs/2611.00558…
LLMエージェントに抗体の親和性改善をやらせたとき、指示にちゃんと従えるのか、何が効くのかを調べた論文。ツールを使わせると指示追従や探索は良くなる一方で最適化性能は下がり、設計履歴を渡すと逆の傾向になる、という面白いトレードオフが出ているようす。最終的にはベイズ最適化と同程度の性能とのこと。
arxiv.org Can agents reliably design therapeutic antibodies? Recent work has demonstrated agents driving protein design workflows, either through orchestration of specialized tools or direct manipulation of sequences. Yet the fidelity with which agents... 
